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商品コード:
GTGE

遺伝子発現解析

関連カテゴリ:
受託解析サービス > マイクロアレイ解析

DNAマイクロアレイ遺伝子発現解析
DNA Microarrray: Gene expression analysis
 


DNAマイクロアレイ 遺伝子発現解析



● RNA抽出からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、RNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス/サポートをご提供致します。

● アレイ/プラットフォーム 
Genomictree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質マイクロアレイ &
ラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。

● 充実した解析データ
RNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter & MA plot/発現
変動データ/Gene Ontology/Pathway等を基本データとして、比較数/反復数/実験条件等に応じて
t-test、ANOVA、クラスタリング解析(Hierarchical, SOM、K-mean等)データをご提供致します。


発現解析アレイ

  • Whole Human Genome 4 x 44k array
  • Whole Mouse Genome 4 x 44k array
  • Whole Rat Genome 4 x 44k array
  • その他(Arabidopsis, C.elegans, Canine, Frog, Magnaporthe grisea, Monkey, Rice, Yeast, Zebrafish)
研究/実験目的に合わせて1色または2色解析法を選択できます 
1色蛍光法・・・1サンプル/1解析 - 多検体/比較解析を目的する実験に推奨
2色蛍光法・・・2サンプル/1解析 - スモールスケール比較などの実験に推奨

価 格
1色法:Whole Human/Mouse/Rat Genome 4 x 44k: ¥140,000~
2色法:Whole Human/Mouse/Rat Genome 4 x 44k: ¥150,000~
RNA抽出/精製:¥15,000/サンプル


実験・解析ワークフロー
Total RNAまたは細胞/組織を送付いただき、RNA品質チェック、cDNA合成/標識cRNA合成、
ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行います。



*1 細胞サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てPBSで洗浄
2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
*2 組織サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るようにTRIzolまたはISOGENを加える
2. -80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
*3 RNA抽出(細胞または組織より)
細胞または組織からのRNA抽出はオプションとなります。別途費用


解析データ内容について
マイクロアレイ解析サービスにはGeneSpring GX解析ソフトウェアによるデータ解析が含まれております
サンプルをご提供頂くだけで、マイクロアレイで得られたすべての解析結果をCDにてお届け致します
データ データ内容 詳細
QCデータ RNAサンプル品質チェック RNA QC
レポート 実験報告書、プロトコル、解析結果 実験・解析報告
画像データ Scanning Image Cy3, Cy5イメージ画像
Scatter Plot 分散グラフ
MA Plot 分散グラフ
Cluster analysis(Hierarchical, k-means, SOM) Heat mapイメージ画像
解析データ Raw data 数値化生データ
Normalized all genes list (ノーマライズ数値データ)
(ID, Gene Symbol, Annotations, Nor Ratio of Cy5/Cy3)
全遺伝子発現データ
Reliable genes list (フィルタリングデータ) Flag-out遺伝子発現データ
Fold changed genes list (2 fold up/down regulated genes) 発現変動遺伝子データ
Gene Ontology 機能別遺伝子分類
T-test *比較/反復数によります 統計解析
ANOVA(1 or 2-way) *比較/反復数によります 統計解析
Clustering (Hierarchical, k-means, SOM)*比較/反復数によります 発現パターン類似遺伝子分類
Pathway analysis パスウェイ遺伝子解析
※解析データ内容はお客様のアレイ実験内容(条件比較数、反復回数等)により異なります。