商品カテゴリから選ぶ
メーカーから選ぶ
商品名を入力

2018年12月
1
2 3 4 5 6 7 8
9 10 11 12 13 14 15
16 17 18 19 20 21 22
23 24 25 26 27 28 29
30 31
2019年1月
1 2 3 4 5
6 7 8 9 10 11 12
13 14 15 16 17 18 19
20 21 22 23 24 25 26
27 28 29 30 31

※赤字は休業日です

ChIP on chip解析
商品コード:
GTCC

ChIP on chip解析

関連カテゴリ:
受託解析サービス > マイクロアレイ解析

プロモーターマイクロアレイ: ChIP on chip解析
Promoter Microarrray: ChIP on chip analysis
 


ChIP on chip解析



● 免疫沈降からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、免疫沈降からデータ解析まで一連のサービス/サポートをご提供致します。

● アレイ/プラットフォーム 
Genomictree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質マイクロアレイ &
ラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。

● 充実した解析データ
免疫沈降データ、生データ & 正規化データ、スキャニング画像、Scatter & MA plot、
染色体ポジションマップ、抗体結合プローブデータ等をご提供致します。


【Promoterマイクロアレイ】
ChIP on chip(クロマチン免疫沈降法とマイクロアレイ)によるゲノム全体を
網羅的に転写因子DNA結合部位領域を同定/解析


● ~21,000の転写因子を網羅したPromoterアレイ  
●  miRNA, samll non-cording RNAを含む1 x 1Mアレイ 
● アレイプローブ間隔: 172 bp(2 x 244k), 75bp(1 x 1M)
● 平均プローブ数/gene(2 x 244k: ~28プローブ/gene), (1 x 1M: ~46プローブ/gene)



● Human Promoter array 2 x 244k
     244k-A (chromosom 1-9), 244k-B (chromosom 10-Y)
● Mouse Promoter array 2 x 244k 
     244k-A (chromosom 1-9), 244k-B (chromosom 10-Y)



● Human Promoter array 1 x 1M
● Mouse Promoter array 1 x 1M 

    
  
【価 格】
Human/Mouse Promoter 2 x 244k: ¥550,000(2色蛍光法:2サンプル/解析)
Human/Mouse Promoter  1 x 1M: ¥600,000(2色蛍光法:2サンプル/解析)
DNA抽出/精製:¥15,000/サンプル
免疫沈降: ¥150,000/サンプル



【免疫沈降ワークフロー】



【Promoterマイクロアレイ実験・解析ワークフロー】
免疫沈降、DNA精製、標識gDNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行います。
※免疫沈降はオプションとなります


*1 細胞サンプル
ホルムアルデヒド処理した細胞を提供頂く場合
細胞培養後、ホルムアルデヒドでfixationして頂き、細胞をチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
DNA断片化から免疫沈降まで弊社にて行います※fixationのプロトコルにつきましてはお問合せ下さい
細胞を提供頂く場合
細胞はチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
細胞を送付頂き、細胞培養-Fixation-免疫沈降を弊社にて行います
※細胞培養はオプション(別途費用)となります

*2 組織サンプル
組織片をチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
Fixation-免疫沈降を弊社にて行います

*3 免疫沈降
細胞または組織サンプルを弊社にて免疫沈降を行います
※免疫沈降はオプション(別途費用)となります
※抗体等はお客様よりご提供頂きます


*4 解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験内容・目的、
サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります。

【解析データ内容について】
マイクロアレイ解析サービスにはGeneSpring GX、Workbench解析ソフトウェアによるデータ解析が含まれております
サンプルをご提供頂くだけで、マイクロアレイで得られたすべての解析結果をCDにてお届け致します

データ データ内容 詳細
QCデータ IP DNA/Input DNA品質チェック 免疫沈降DNA QC
レポート 実験報告書、プロトコル、解析結果 実験・解析報告
画像データ Scanning Image Cy3, Cy5イメージ画像
Scatter Plot 分散グラフ
MA Plot 正規化分散グラフ
Chromasom map 染色体マップ
解析データ Raw data 数値化生データ
All genes/All probes data (ノーマライズ数値データ)
(ID, Gene Symbol, Annotations, Nor Ratio of Cy5/Cy3)
全遺伝子/プローブデータ
Antibody binding genes list 抗体特異的結合プローブデータ
T-test *比較/反復数によります 統計解析
ANOVA(1 or 2-way) *比較/反復数によります 統計解析
Clustering (Hierarchical, k-means, SOM)*比較/反復数によります パターン類似遺伝子分類
※解析データ内容はお客様のアレイ実験内容(条件比較数、反復回数等)により異なります。