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CpG Island DNAメチレーション解析
商品コード:
GTCG

CpG Island DNAメチレーション解析

関連カテゴリ:
受託解析サービス > マイクロアレイ解析
受託解析サービス > DNAメチル化解析

DNAメチレーション解析
CpG Island Microarray: DNA methylation analysis
 


DNAメチレーション解析



● メチル化DNA濃縮からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、メチル化DNA濃縮してデータ解析まで一連のサービス/サポートをご提供致します。

● アレイ/プラットフォーム 
Genomictree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質マイクロアレイ &
ラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。

● 充実した解析データ
メチル化DNA濃縮データ、生データ & 正規化データ、スキャニング画像、Scatter & MA plot、
染色体ポジションマップ、Hyper/Hypomethylated遺伝子データ等をご提供致します。


【CpG Islandマイクロアレイ】
CpGアイランドのDNAメチル化状態を網羅的にプロファイリング
各CpGアイランドに複数箇所設計された長鎖プローブ搭載



Human CpG Island 1 x244k array

   Human 237,220アレイプローブは27,800のCpGアイランド領域をカバー

Mouse CpG Island 2 x 105k array
   Mouse 97,651アレイプローブは16,030のCpGアイランド領域をカバー


【価 格】
Human CpG Island 1 x 244k: ¥400,000(2色蛍光法:2サンプル/解析)
Mouse CpG Island  2 x 105k: ¥350,000(2色蛍光法:2サンプル/解析)
DNA抽出/精製:¥15,000/サンプル
メチル化DNA濃縮: ¥80,000/サンプル



メチル化DNA濃縮ワークフロー:MBD2b使用】



CpG Islandマイクロアレイ実験・解析ワークフロー】
メチル化DNAを増幅、ラベリング、ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行います

*1 細胞サンプルを提供頂く場合
細胞はチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
細胞を送付頂き、メチル化DNAを濃縮、免疫沈降を弊社にて行います。
※メチル化DNAを濃縮、免疫沈降はオプション(別途費用)となります


*2 組織サンプルを提供頂く場合
組織片をチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
細胞を送付頂き、メチル化DNAを濃縮、免疫沈降を弊社にて行います。
※メチル化DNAを濃縮、免疫沈降はオプション(別途費用)となります

*3 メチル化DNA濃縮/免疫沈降
細胞または組織サンプルからMBD2bタンパクにてメチル化DNAを濃縮を行います。
抗体を用いて免疫沈降も行います。
※メチル化DNA濃縮および免疫沈降はオプション(別途費用)となります。
※抗体等はお客様よりご提供頂きます

*4 解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験内容・目的、
サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります。



【解析データ内容について】
マイクロアレイ解析サービスにはGeneSpring GX、Workbench解析ソフトウェアによるデータ解析が含まれております
サンプルをご提供頂くだけで、マイクロアレイで得られたすべての解析結果をCDにてお届け致します

データ データ内容 詳細
QCデータ メチル化DNA品質チェック チル化DNA QC
レポート 実験報告書、プロトコル、解析結果 実験・解析報告
画像データ Scanning Image Cy3, Cy5イメージ画像
Scatter Plot 分散グラフ
MA Plot 正規化分散グラフ
Chromasom map 染色体マップ
Cluster analysis(Hierarchical, k-means, SOM) Heat map画像
解析データ Raw data 数値化生データ
Normalized all genes list (ノーマライズ数値データ)
(ID, Gene Symbol, Annotations, Nor Ratio of Cy5/Cy3)
全遺伝子発現データ
Reliable genes list (フィルタリングデータ) Flag-out遺伝子発現データ
Hypermethylated/Hypomethylated genes list 高/低メチル化遺伝子データ
T-test *比較/反復数によります 統計解析
ANOVA(1 or 2-way) *比較/反復数によります 統計解析
Clustering (Hierarchical, k-means, SOM)*比較/反復数によります パターン類似遺伝子分類
※解析データ内容はお客様のアレイ実験内容(条件比較数、反復回数等)により異なります。