DNAマイクロアレイ | 遺伝子発現解析

Home
製品情報
マイクロアレイ受託解析
DNAマイクロアレイ遺伝子発現解析 miRNAプロファイリング1 　(Human, Mouse, Rat) miRNAプロファイリング2 　(miRBase：全生物種、　 PMRD：植物種に対応) アレイCGH/CNV ChIP on chip CpG Island
DNAメチレーション受託解析
MSP パイロシーケンス Bisulfite シーケンス CpG Islandマイクロアレイメチル化DNA抽出/濃縮
DNAメチレーション研究関連製品
メチル化DNA検出　PCRプライマーセットメチル化DNA抽出キット

ジェノタイピング
BRAFミューテーション KRAFミューテーション HPVジェノタイピング
その他受託解析
マルチプレックス　-サイトカイン/ケモカイン他 cDNAマイクロアレイ作製　(クローニングから対応) 免疫染色

癌関連遺伝子の探索などのスクリーニング的な用途、発現変動する遺伝子を網羅的に解析

RNA抽出からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、RNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス/サポートを
提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社（Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約2～3週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
RNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/発現変動データ/Gene Ontology/Pathway等を基本データとして、比較数/
反復数/実験条件等に応じてt-test、ANOVA、クラスタリング解析(Hierarchical, SOM、
K-mean等)データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。

転写産物を含む41000プローブを搭載

アレイフォーマット4x44k

発現解析用アレイ

● Whole Human Genome array 4x44k
● Whole Mouse Genome array 4x44k
● Whole Rat Genome array 4x44k
● その他(Arabidopsis, C.elegans, Canine, Frog, 　
Magnaporthe grisea, Monkey, Rice, Yeast, Zebrafish)

研究/実験目的に合わせて1色または2色解析法を選択できます

1色蛍光法・・・1サンプル/1解析 - 多検体/比較解析を目的する実験に推奨

2色蛍光法・・・2サンプル/1解析 - スモールスケール比較などの実験に推奨

実験ワークフロー
Total RNAまたは細胞/組織を送付いただき、RNA品質チェック、cDNA合成/標識cRNA
合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行いを行います。

QCデータ	RNAサンプル品質チェック	RNA QC Data	PDF
レポート	実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method	実験・結果報告書	PDF
画像データ	Scanning image	Cy3, Cy5アレイ画像	TIFF
	Scatter Plot	分散図	JPEG
	MA Plot	正規化分散図	JPEG
	Pathway map	遺伝子パスウェイ図	JPEG
	Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM)	ヒートマップ	JPEG
解析データ	Row Data	数値化生データ	Text
	Normalized all genes data (2色：LOWESS、1色：50th percentile)	全遺伝子正規化データ	Excel
	Reliable genes data(flug-outl)	優位性遺伝子データ	Excel
	fold-change genes date (2倍差発現遺伝子)	発現変動遺伝子データ	Excel
	Gene Ontology	機能別遺伝子クラシフィケーション	Excel
	Pathway analysis	パスウェイ遺伝子解析	Excel
	t-test (反復数によります)^*4	t検定統計解析	Excel
	ANOVA -1way, 2way (反復、比較数によります)^*4	統計解析	Excel
	Clustering -Hierarchical, k-means, SOM (反復、比較数によります)^*4	発現パターン類似遺伝子分類	Excel

^*1 細胞サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄
2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

^*2組織サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るようにTRIzoｌ
　　またはISOGENを加える
2. -80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

^*3RNA抽出（細胞または組織）
細胞または組織からのRNA抽出はオプションとなります。別途費用

^*4　解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数（条件比較数、反復回数等）により異なります。