各遺伝子領域における染色体コピー数の異常、癌の遺伝子増幅、
染色体欠失を検出し、ゲノムワイドに解析

DNA抽出からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、DNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス/サポートを
提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社（Agilent Authorized Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約2～3週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
DNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/Chromasom map/増幅・欠失遺伝子データ/Gene Ontology/Pathway等を
基本データとして、比較数/反復数/実験条件等に応じてt-test、ANOVA、クラスタ
リング解析(Hierarchical, SOM、K-mean等)データを提供致します。また、実施した
アレイデータに対する追加解析は無償で行います。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。

　遺伝子、遺伝子間、サブテロメア領域を含む240,000プローブを搭載
● Human Genome CGH array 244k
● Mouse Genome CGH array 244k
● Rat Genome CGH array 244k

● Human Genome CGH array 2 x 105k
● Mouse Genome CGH array 2 x 105k
● Rat Genome CGH array 2 x 105k

CGHアレイフォーマット

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2色蛍光法・・・2サンプル/1解析

ゲノムDNAまたは細胞/組織を送付いただき、DNA品質チェック、gDNA増幅、
gDNA制限酵素処理、標識gDNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、
データ解析を行いを行います。

ゲノムDNAの場合

DNA量	サンプル濃度	OD260/280
0.5-1ug	0.1ul/ul以上	1.8以上

推奨RNA品質
ゲノムDNA(細胞) 28s/18s>1.0, OD260/280 >2.0, OD230/260 >1.6
ゲノムDNA(組織) 28s/18s>1.0, OD260/280 >1.8, OD230/260 >1.6
※サンプルはNuclease free waterに溶解して下さい
※サンプルは十分なドライアイスで梱包頂き発送して下さい

細胞または組織サンプルの場合

サンプル	サンプル量	サンプル前処理
細　胞	1 x 10⁷以上	TRIzol, ISOGEN
組　織	50mg以上	TRIzol, ISOGEN
パラフィン	10um厚x10切片

細胞サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄
2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

組織サンプルを提供頂く場合の前処理
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るようにTRIzoｌ
　　またはISOGENを加える
2. -80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送

パラフィンサンプルを提供頂く場合の前処理
1.. パラフィン切片を慎重にチューブに入れて4℃で保存
2. サンプルを保冷剤で梱包して発送

お客様から提供頂いた細胞または組織サンプルからDNAを抽出致します
※細胞または組織からのDNA抽出はオプションになります

電気泳動/NanoDropを使用してDNAの品質チェックを行います

DNAのQC結果はレポートにして提出致します

レポートはOD260/280, OD260/230, 電気泳動を含みます

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※DNAの品質が規定に満たない場合、再提出いただきます。
※細胞、組織またはパラフィンサンプルからのDNA品質が上記に満たない場合、
DNAに分解が見られた場合再提出をお願いすることがあります。
※再提出サンプル分につきましては無償対応致します。

DNAサンプルを増幅して制限酵素処理を行い、gDNAをフラグメントにします。
Cyanine色素を取り込ませて蛍光標識します。-------------------　---------------------------------------------- -

蛍光標識されたgDNAをアレイにハイブリダイズさせます。

Microarray Scanner（Agilent Technologies社）でシグナルを検出します。

マイクロアレイ受託解析サービスにはGeneSpring解析ソフトウェアによるデータ解析が
含まれています。サンプルをご提供いただくだけで、マイクロアレイで得られたすべての
データ、解析結果レポート、Materials & MethodsをCDにて納品および解析データ内容に
ついてサポート致します。　※追加データマイニングにつきまして無償で行います

QCデータ	DNAサンプル品質チェック	DNA QC Data	PDF
レポート	実験報告書、スキーム、解析結果、Materials & Methods	実験・結果報告書	PDF
	Scanning image	Cy3, Cy5アレイ画像	TIFF, JPEG
	Scatter Plot	分散図	JPEG
画像データ	MA Plot	正規化分散図	JPEG
	CGH explorer result	染色体マップ	JPEG
	Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM)	ヒートマップ	JPEG
	Row Data	数値化生データ	Text
	Normalized all genes data (2色：LOWESS法、)	全遺伝子正規化データ	Excel
	Reliable genes data(flug-out, cross gene error model)	優位性遺伝子データ	Excel
	fold-change genes date (1.5倍gain/loss遺伝子)	増幅・欠失遺伝子データ	Excel
解析データ	Gene Ontology	機能別遺伝子クラシフィケーション	Excel
	Pathway analysis	パスウェイ遺伝子解析	Excel
	t-test (*反復数によります)	t検定統計解析	Excel
	ANOVA -1way, 2way (*反復、比較数によります)	統計解析	Excel
	Clustering -Hierarchical, k-means, SOM (*反復、比較数によります	発現パターン類似遺伝子分類	Excel