CpGアイランドのDNAメチル化状態を網羅的にプロファイリング！



メチル化DNA抽出からデータ解析までのトータルサポート
細胞・組織より、メチル化DNAを抽出/精製してデータ解析まで一連のサービス
/サポートを提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社（Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約3週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
解析データ
DNA品質データ/アレイ画像/生データ/正規化データ/Reliable gene data/Scatter &
MA plot/発現変動データを基本データとして、比較数/反復数/実験条件等に応じて
クラスタリング解析(Hierarchical, SOM、K-mean等)データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。

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各CpGアイランドに複数箇所設計された長鎖プローブ搭載

CpG Islandアレイフォーマット		CpG Islandアレイ		アレイプローブ
		● Human CpG Island array 244k Human 237,220アレイプローブは 27,800のCpGアイランド領域をカバー 2色蛍光法・・・2サンプル/1解析
		● Mouse CpG Island array 2x105k Mouse 97,651アレイプローブは 16,030のCpGアイランド領域をカバ 2色蛍光法・・・2サンプル/1解析

メチル化DNA抽出/濃縮 (MeDIA: Methylated DNA Isolation & Amplification)
受託解析ワークフロー ゲノムDNAまたは細胞/組織を送付いただき、DNA品質チェック、gDNAフラグメント （超音波処理）、メチル化DNA抽出/濃縮(MBD2btタンパク質)、DNA増幅・ラベリング、 ハイブリダイゼーション、スキャニング、データ解析を行います
QCデータ DNA品質(メチル化DNA抽出・濃縮)チェック メチル化DNA QC Data PDF レポート 実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method 実験・結果報告書 PDF 画像データ Scanning image Cy3, Cy5アレイ画像 TIFF Scatter Plot 分散図 JPEG MA Plot 正規化分散図 JPEG CGH explorer (Chromosome) map 遺染色体マップ JPEG Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM) ヒートマップ JPEG 解析データ Row Data 数値化生データ Text Normalized all genes data 全遺伝子正規化データ Excel Reliable genes data(flag-out) 優位性遺伝子データ Excel Hyper & Hypomethylated genes date メチル化/非メチル化遺伝子抽出データ Excel Clustering -Hierarchical, k-means, SOM (反復、比較数によります)*4 発現パターン類似遺伝子分類 Excel

^*1 細胞サンプルを提供頂く場合
1. 10cmシャーレで細胞培養後、培地を捨てて、PBSで1回洗浄
2. 約1mlのTRIzolまたはISOGENを加え、ピペットでよく攪拌
3. サンプルをチューブに移して-80℃で凍結
4. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
細胞からのDNA抽出はオプション(別途費用)となります

^*2組織サンプルを提供頂く場合
1. 組織片をチューブに入れて、サンプルが完全に浸るように
　 TRIzoｌまたはISOGENを加える
2. -80℃で凍結
3. サンプルを十分なドライアイスで梱包して発送
組織からのDNA抽出はオプション(別途費用)となります

^*3メチル化DNA抽出・濃縮
DNAおよび細胞または組織からの抽出DNAからメチル化DNAの
抽出/濃縮を行います-オプション(別途費用)となります

^*4　解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数（条件比較数、反復回数等）により異なります



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