ChIP on Chip | プロモーターアレイ

ChIP-on-Chip(クロマチン免疫沈降法とマイクロアレイ)によるゲノム
全体を網羅的に転写因子DNA結合部位領域を同定/解析

免疫沈降からデータ解析までのトータルサポート
免疫沈降からデータ解析まで一連のサービス/サポートを提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社（Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約4週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
DNA品質 / IP QCデータ / アレイ画像/生データ / 正規化データ / Reliable gene data / Scatter
& MA plot / IP特異的変動データ / Gene Ontology等を基本データとして、比較数/反復数/
実験条件等に応じてクラスタリング解析等データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。

転写産物を最大17,000カバー/転写開始点の-5.5kbから＋2.5kb
474,411プローブ(Human) ～25プローブ/gene
474,3801プローブ(Mouse): ～25プローブ/gene

488kアレイフォーマット (244kアレイx2枚)

　　アレイ種類

244k-A

244k-B

● Human Promoter array 488k ChIP-on-chip
----244k-A (chromosom 1-9)----244k-B (chromosom 10-Y)
● Mouse Promoter array 488k ChIP-on-chip
--- 244k-A (chromosom 1-9)----244k-B (chromosom 10-Y)

● Arabidopsis Promoter array 488k ChIP-on-chip
● C.Elegance Promoter array 488k ChIP-on-chip
● Drosphila Promoter 488K ChIP-on-chip
● Zebrafish Promoter 488K ChIP-on-chip
● Yeast Promoter 244K ChIP-on-chip

免疫沈降

アレイプローブ

実験ワークフロー
免疫沈降済DNAまたは細胞/組織を送付いただき、クロスリンク、DNA断片化、
免疫沈降、DNA精製、、標識gDNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、
データ解析を行いを行います。*免疫沈降はオプションとなります

QCデータ	IP & WCE-DNA QC Data	DNA品質/免疫沈降処理	PDF
レポート	実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method	実験・結果報告書	PDF
画像データ	Scanning image	Cy3, Cy5アレイ画像	TIFF
	Scatter Plot	分散図	JPEG
	MA Plot	正規化分散図	JPEG
	CGH explorer (Chromosome) map	遺染色体マップ	JPEG
	Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM)	ヒートマップ	JPEG
解析データ	Row Data	数値化生データ	Text
	Normalized all genes data	全遺伝子正規化データ	Excel
	Reliable genes data(flug-outl)	優位性遺伝子データ	Excel
	fold-change genes date	IP特異的変化遺伝子	Excel
	Clustering -Hierarchical, k-means, SOM (反復、比較数によります)^*4	発現パターン類似遺伝子分類	Excel

^*1 細胞サンプル
ホルムアルデヒド処理した細胞を提供頂く場合
細胞培養後、ホルムアルデヒドでfixationして頂き、細胞をチューブに入れてドライアイスで梱包/発送
DNA断片化から免疫沈降まで弊社にて行います　※fixationのプロトコルに
つきましてはお問合せ下さい
細胞を提供頂く場合
細胞はチューブに入れてドライアイスで梱包/発送
細胞を送付頂き、細胞培養-Fixation-免疫沈降を弊社にて行います
※細胞培養はオプション(別途費用)となります

^*2 組織サンプル
組織片をチューブに入れてドライアイスで梱包/発送
Fixation-免疫沈降を弊社にて行います

^*³ 免疫沈降
細胞または組織サンプルを弊社にて免疫沈降を行います
※免疫沈降はオプション(別途費用)となります
※抗体等はお客様よりご提供頂きます

^*4解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数（条件比較数、反復回数等）により異なります。

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DNAマイクロアレイ遺伝子発現解析 miRNAプロファイリング1 　(Human, Mouse, Rat) miRNAプロファイリング2 　(miRBase：全生物種、　 PMRD：植物種に対応) アレイCGH/CNV ChIP on chip CpG Island
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