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 -
サイトカイン/ケモカイン他

cDNAマイクロアレイ作製
 
(クローニングから対応)
免疫染色


ChIP-on-Chip
(クロマチン免疫沈降法とマイクロアレイ)によるゲノム
全体を網羅的に転写因子DNA結合部位領域を同定/解析

概  要

免疫沈降からデータ解析までのトータルサポート

免疫沈降からデータ解析まで一連のサービス/サポートを提供致します。
アレイ/プラットフォーム
GenomicTree社(Agilent Certified Service Provider)によるアジレント社高品質
マイクロアレイ&プラットフォームを使用して信頼性の高いデータを提供致します。
Fast Service
サンプルをお預かりしてから、約4週間で解析データ/実験報告書を提出致します。
充実した解析データ
DNA品質 / IP QCデータ / アレイ画像/生データ / 正規化データ / Reliable gene data / Scatter
& MA plot / IP特異的変動データ / Gene Ontology等を基本データとして、比較数/反復数/
実験条件等に応じてクラスタリング解析等データを提供致します。
品質方針 (ISO9001:2000取得)
顧客の信頼を得る受託解析サービスの提供を心掛け品質マネジメントシステムの
継続的改善と技術の向上を計り、顧客の満足を高めます。




転写産物を最大17,000カバー/転写開始点の-5.5kbから+2.5kb
474,411プローブ(Human) 〜25プローブ/gene
474,3801プローブ(Mouse): 〜25プローブ/gene







488kアレイフォーマット (244kアレイx2枚)   アレイ種類

244k-A


244k-B
Human Promoter array 488k ChIP-on-chip
----244k-A (chromosom 1-9)----244k-B (chromosom 10-Y)
Mouse Promoter array 488k ChIP-on-chip
--- 244k-A (chromosom 1-9)----244k-B (chromosom 10-Y)

Arabidopsis Promoter array 488k ChIP-on-chip
● C.Elegance Promoter array 488k ChIP-on-chip
● Drosphila Promoter 488K ChIP-on-chip
● Zebrafish Promoter 488K ChIP-on-chip
● Yeast Promoter 244K ChIP-on-chip



免疫沈降 アレイプローブ

実験ワークフロー
免疫沈降済DNAまたは細胞/組織を送付いただき、クロスリンク、DNA断片化、
免疫沈降、DNA精製、、標識gDNA合成、ハイブリダイゼーション、スキャニング、
データ解析を行いを行います。*免疫沈降はオプションとなります


QCデータ IP & WCE-DNA QC Data DNA品質/免疫沈降処理 PDF
レポート 実験報告書、スキーム、解析結果、Materias & Method 実験・結果報告書 PDF
画像データ Scanning image Cy3, Cy5アレイ画像 TIFF
Scatter Plot 分散図 JPEG
MA Plot 正規化分散図 JPEG
CGH explorer (Chromosome) map 遺染色体マップ JPEG
Clustering-tree view (Hierarchical, k-means, SOM) ヒートマップ JPEG
解析データ Row Data 数値化生データ Text
Normalized all genes data 全遺伝子正規化データ Excel
Reliable genes data(flug-outl) 優位性遺伝子データ Excel
fold-change genes date IP特異的変化遺伝子 Excel
Clustering -Hierarchical, k-means, SOM
(反復、比較数によります)*4
発現パターン類似遺伝子分類 Excel

*1 細胞サンプル
ホルムアルデヒド処理した細胞を提供頂く場合

細胞培養後、ホルムアルデヒドでfixationして頂き、細胞をチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
DNA断片化から免疫沈降まで弊社にて行います ※fixationのプロトコルに
つきましてはお問合せ下さい
細胞を提供頂く場合
細胞はチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
細胞を送付頂き、細胞培養-Fixation-免疫沈降を弊社にて行います

※細胞培養はオプション(別途費用)となります

*2 組織サンプル
組織片をチューブに入れて ドライアイスで梱包/発送
Fixation-免疫沈降を弊社にて行います

*3 免疫沈降
細胞または組織サンプルを弊社にて免疫沈降を行います
※免疫沈降はオプション(別途費用)となります
※抗体等はお客様よりご提供頂きます

*4解析データ内容について
データマイニング・解析データ内容はサンプル数、お客様のアレイ実験
内容・目的、サンプル数(条件比較数、反復回数等)により異なります。







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